Ekonomik ve Toplumsal Araştırmalar Merkezi (BETAM)
Sürekli Eğitim Merkezi (BAUSEM)
Medeniyet Araştırmaları Merkezi (MEDAM)
Gelibolu Yüzüncü Yıl Uygulama ve Araştırma Merkezi
Global Hukuk Devleti İlkeleri Programı Direktörlüğü (IGUL)
Öğretmen Mesleki Gelişim, Uygulama ve Araştırma Merkezi (ÖGAM)
Büyük Veri Uygulama ve Araştırma Merkezi
Uluslararası Liderlik Araştırma ve Uygulama Merkezi (ULMER)
Kreatif Endüstriler Araştırma ve Uygulama Merkezi (BAUKEM)
Güvenlik Araştırmaları ve Uygulama Merkezi (BAUCESS)
Toplum, Sağlık, Davranış ve Önlem Alma Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi
Mesleki Teknik Eğitimi Geliştirme Birimi (METGEM)
BAU Finansal Araştırma ve Uygulama Merkezi (BFRC)
Türkçe ve Yabancı Diller Uygulama ve Araştırma Merkezi
Siber Güvenlik Araştırma ve Uygulama Merkezi
Öğrenme ve Öğretme Uygulama ve Araştırma Merkezi
BAUICE – Kuluçka ve Girişimcilik Uygulama ve Araştırma Merkezi
BAUDEGS - Bahçeşehir Üniversitesi Denizcilik ve Global Stratejiler Merkezi
CO-OP&Kariyer Geliştirme Uygulama ve Araştırma Merkezi